Η φασματοσκοπία Raman και υπέρυθρης ακτινοβολίας βοηθά στον εντοπισμό διαφορετικών ακετυλ λυσινών

Μοριακές δομές λυσίνης και τριών ακετυλ λυσινών. Πίστωση: Yao Guohua

Μια ερευνητική ομάδα με επικεφαλής τον καθηγητή Huang Cheng των Ινστιτούτων Φυσικών Επιστημών Hefei (HFIPS) της Κινεζικής Ακαδημίας Επιστημών χρησιμοποίησε φασματοσκοπία υπερύθρου και Raman για να προσδιορίσει τα χαρακτηριστικά της ακετυλ-λυσίνης, παρέχοντας μια θεωρητική και πειραματική βάση για την ανάλυση της πρωτεΐνης ακετυλοχολίνης δομές. σε βιολογικά συστήματα.


Τα αποτελέσματά τους δημοσιεύτηκαν στο Spectrochimica Acta Μέρος Α: Μοριακή και Βιομοριακή Φασματοσκοπία.

Η ακετυλοχολίνη είναι μια κοινή και σημαντική τροποποίηση πρωτεΐνης στη βιολογία που παίζει βασικό ρυθμιστικό ρόλο στον κυτταρικό μεταβολισμό. Υπάρχουν δύο τρόποι για την πρωτεΐνη ακετυλίωσηΗ μία είναι η Νε-ακετυλίωση ειδική για τα υπολείμματα λυσίνης και η άλλη είναι η Ν-τερματική ακετυλίωση που μπορεί να συμβεί σε διαφορετικά υπολείμματα αμινοξέων.

Επί του παρόντος, η Ν-τερματική ακετυλοτρανσφεράση χρησιμοποιείται γενικά για επισήμανση για να προσδιοριστεί εάν ένα υπόλειμμα λυσίνης είναι ακετυλιωμένο, αλλά η ακρίβεια αυτής της μεθόδου εξακολουθεί να είναι αμφιλεγόμενη. Προσδιορισμός ακετυλίωσης πρωτεΐνης σε μοριακό επίπεδο Είναι μια από τις τρέχουσες ερευνητικές προκλήσεις και το κλειδί είναι να προσδιοριστεί με ακρίβεια και να χαρακτηριστεί η ακετυλ-λυσίνη για να αποκτηθεί μια σαφής και συστηματική κατανόηση.

Για να λύσει αυτό το πρόβλημα, η ερευνητική ομάδα μελέτησε συστηματικά τις δομικές αλλαγές και τις αντίστοιχες φασματικές ιδιότητες δόνησης των τριών τύπων ακετυλίου (Nε-Ace-Lys, Nα-Ace-Lys και NαNε-Ace-Lys) της L-λυσίνης μέσω υπέρυθρων και Πειράματα ανάλυσης Raman Υπολογισμοί φασματοσκοπίας και θεωρίας συναρτήσεων πυκνότητας. Βρήκαν ότι οι χαρακτηριστικές ζώνες IR και Raman της αμιδικής ομάδας, της καρβοξυλικής ομάδας και άλλων ομάδων μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την αποτελεσματική αναγνώριση διαφορετικών τύπων ακετυλίου.

Η φασματοσκοπία Raman και υπέρυθρης ακτινοβολίας βοηθά στον εντοπισμό διαφορετικών ακετυλ λυσινών

Κάτω: θεωρητικά υπολογισμένα υπέρυθρα φάσματα του πολυπεπτιδίου Lys-G4 και των τριών ακετυλιωμένων μορίων του. Το κόκκινο είναι Να-ακετύλιο και το μπλε είναι Νε-ακετύλιο. Πίστωση: Yao Guohua

Με άλλα λόγια, εάν μια λυσίνη είναι ακετυλιωμένη μπορεί να γίνει γνωστό από τις ιδιότητες IR και τα φάσματα Raman, καθώς και από τον τύπο της λυσίνης.

Ταυτόχρονα, η στρατηγική προσδιορισμού της φασματοσκοπίας δόνησης της ομάδας για την ακετυλίωση στο πεπτιδικό μοντέλο επικυρώθηκε επίσης.

Αυτή η εργασία παρουσιάζει την ανάλυση του τρόπου δόνησης της ακετυλιωμένης λυσίνης και προτείνει μια νέα φασματοσκοπική μέθοδο αναγνώρισης και χαρακτηρισμού για την ακετυλιωμένη λυσίνη.


Οι ερευνητές εντοπίζουν μια βασική πρωτεΐνη σε έναν μηχανισμό που ελέγχει τη ζωή των πρωτεϊνών


περισσότερες πληροφορίες:
Guohua Yao et al, Μια θεωρητική και πειραματική μελέτη των φασμάτων υπέρυθρων και Raman της ακετυλο-L-λυσίνης, Spectrochimica Acta Μέρος Α: Μοριακή και Βιομοριακή Φασματοσκοπία (2022). DOI: 10.1016 / j.saa.2022.121371

το απόσπασμα: Η φασματοσκοπία Raman και υπέρυθρης ακτινοβολίας βοηθά στον εντοπισμό διαφορετικών λυσινών (2022, 24 Ιουνίου) Ανακτήθηκε στις 24 Ιουνίου 2022 από https://phys.org/news/2022-06-raman-infrared-spectroscopy-acetylated-lysines.html

Αυτό το έγγραφο υπόκειται σε πνευματικά δικαιώματα. Ανεξάρτητα από οποιαδήποτε δίκαιη συναλλαγή για σκοπούς ιδιωτικής μελέτης ή έρευνας, κανένα μέρος δεν επιτρέπεται να αναπαραχθεί χωρίς γραπτή άδεια. Το περιεχόμενο παρέχεται μόνο για ενημερωτικούς σκοπούς.

READ  Χρησιμοποιήστε ολογράμματα για να φωτίσετε τον χώρο απορρύθμισης

Αφήστε μια απάντηση

Η ηλ. διεύθυνση σας δεν δημοσιεύεται. Τα υποχρεωτικά πεδία σημειώνονται με *